DNA-Codons & Translation

Eine DNA- oder RNA-Sequenz in 5′→3′-Richtung einfügen, optional mit FASTA-Kopfzeile, dann übersetzen. Leerraum und Kleinbuchstaben sind erlaubt, ebenso die IUPAC-Codes R Y S W K M B D H V N. Zahlen, Lücken, mehrere Datensätze und gemischtes T/U werden abgewiesen.

Raster +1/+2/+3 beginnen bei Eingabebase 1/2/3. Raster −1/−2/−3 nutzen das Reverse-Komplement ab dessen Base 1/2/3. Codon-Positionen beziehen sich auf die ursprüngliche Eingabe und zählen ab 1; im Rückwärtsraster laufen sie absteigend. Die RNA-Schreibweise ersetzt T durch U in der orientierten codierenden Sequenz; sie modelliert keine Transkription des Matrizenstrangs.

Übersetzt wird das gesamte Raster, ohne Genvorhersage oder CDS-Validierung. Es wird kein Startcodon gesucht, kein alternativer Start in Methionin umgewandelt, kein Intron entfernt und nicht am ersten Stopp abgebrochen. * markiert jeden Stopp. Unvollständige Endcodons werden ausgelassen und gemeldet. Ein mehrdeutiges Codon ergibt nur dann eine bestimmte Aminosäure, wenn alle möglichen Tripletts übereinstimmen; sonst X, auch bei möglichen Aminosäure/Stopp-Mischungen.

NCBI-Code 1 (Standard) oder 2 (Wirbeltier-Mitochondrien) wählen. Letzterer ist eine Codon-Tabellenzuordnung ohne kontextabhängige Rasterverschiebungen oder RNA-Editing. Die optionale Referenz folgt dem gewählten Code. Codon-Details zeigen höchstens 300 Zeilen; CSV exportiert alle Positionen/Codons. Protein kopieren liefert die reine Einbuchstabenfolge; FASTA nennt die gewählten Raster und den Code in den Kopfzeilen.

Alles wird lokal im Browser verarbeitet. Grenze: 100.000 Basen und 1 Million Eingabezeichen. Bei Eingabe- oder Einstellungsänderungen werden Ergebnisse entfernt. Sequenzen und Einstellungen werden nicht dauerhaft gespeichert.