Contenido FASTA GC y complemento inverso

Pegue FASTA o ADN/ARN crudo; obtenga % de GC/AT, recuentos de bases y complemento inverso por registro.

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Pega ADN/ARN o varias secuencias FASTA y elige Analizar. El resumen muestra la longitud con los códigos IUPAC, el contenido GC y el número de bases ambiguas. Con varias secuencias, la lista elige la utilizada para la salida y los recuentos.

GC % = 100 × (G+C)/(A+C+G+T+U). Los códigos IUPAC ambiguos se excluyen de este denominador, pero nunca se borran. Sin bases inequívocas aparece —. Recuento de bases muestra el porcentaje GC mínimo y máximo posible sobre toda la secuencia: S es GC seguro, W es AT seguro; otros códigos pueden tener varias posibilidades.

El complemento inverso se expresa en dirección 5′→3′ y conserva todos los códigos IUPAC, por ejemplo R↔Y y B↔V. Como entrada usa U para ARN y T en los demás casos; sin T/U se elige ADN. La elección de salida solo cambia el alfabeto, no la estadística de la entrada original.

Copiar toma la secuencia elegida sin encabezado. FASTA exporta todos los complementos inversos con los encabezados originales más RC, o sequence_1 para entrada sin encabezado. Las líneas tienen como máximo 80 caracteres. CSV contiene estadísticas de todas las secuencias y códigos; los porcentajes tienen doce cifras significativas.

Se aceptan espacios y minúsculas. Los encabezados empiezan por > y necesitan un nombre. Se rechazan números, huecos, otros símbolos, secuencias vacías, secuencia sin encabezado antes de un encabezado FASTA y T/U mezclados en una secuencia. Máximo 500 000 bases en total, 200 secuencias y un millón de caracteres de entrada; nada se trunca. Procesamiento local.